在研究生培养层次，北京大学外国语学院是外国语言文学一级学科博士点，下设10个二级学科博士点，包括英语语言文学、印度语言文学、亚非语言文学、法语语言文学、德语语言文学、俄语语言文学、西班牙语言文学、日本语言文学、阿拉伯语言文学、外国语言学及应用语言学。以上10个二级学科博士点均招收博士和硕士研究生。另外，学院的世界文学专业可招收硕士研究生;学院设有翻译专业硕士学位点。还设有博士后流动站，每年都有数位博士后研究人员进站进行研究。

北京大学的外国语言文学学科在国内外享有良好的学术声誉，得到社会各界和国内外同行的认可。在2004年全国一级学科整体水平评估中，北京大学的外国语言文学学科取得了整体水平、学术队伍、科学研究、人才培养、学术声誉5个单项100分，居全国同行之首。在2008年全国一级学科整体水平评估中，又蝉联总分第一，取得了优异的成绩。